近日，真邁生物和達(dá)普生物強(qiáng)強(qiáng)合作，聯(lián)合發(fā)布GenoLab M基因測序儀檢測臨床腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組樣本的評測數(shù)據(jù)。
本次測評基于達(dá)普Galaxy星海單細(xì)胞測序建庫系統(tǒng)完成兩類臨床腫瘤單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組文庫制備，制備好的文庫由達(dá)普生物分別在GenoLab M和NovaSeq 6000上進(jìn)行測序，測序數(shù)據(jù)分析表明，GenoLab M 表現(xiàn)優(yōu)異，與對比平臺(tái)檢測出的單細(xì)胞UMI水平、細(xì)胞聚類、同基因表達(dá)量結(jié)果高度一致。
01 實(shí)驗(yàn)方案
1. 測試用樣本：兩種不同腫瘤組織制備而成的單細(xì)胞懸濁液；
2. 單細(xì)胞建庫系統(tǒng)：文庫制備試劑：星海單細(xì)胞 3' 轉(zhuǎn)錄組測序建庫試劑盒（Galaxy Single Cell 3' mRNA Kit v1.0)；文庫制備平臺(tái)：星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng)(Galaxy Single Cell ?Analysis System）；
3. 測試平臺(tái)：GenoLab M、NovaSeq 6000；
4. 測試實(shí)驗(yàn)：使用達(dá)普生物星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng)與3' 轉(zhuǎn)錄組測序建庫試劑盒對兩種不同腫瘤組織解離后得到單細(xì)胞懸濁液進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序文庫制備（下文簡稱S1、S2）。構(gòu)建好的文庫分別在GenoLab M、NovaSeq 6000測序平臺(tái)上進(jìn)行測序。
02 測試結(jié)果
GenoLab M 測試結(jié)果與對比平臺(tái)一致性高
對GenoLab M和NovaSeq 6000測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，S1和S2樣本在兩平臺(tái)檢測細(xì)胞UMI水平、細(xì)胞聚類、同基因的表達(dá)量等結(jié)果高度一致（圖1~3）。
圖1 細(xì)胞UMI分析結(jié)果
（左：S1；右：S2）
●Single-cell clustering 對比
?S1：
?S2：
圖2 細(xì)胞聚類分析
●Barcode assignment 對比
? ? S1：
? ? S2：
圖3 同一cell barcode 的 UMI及基因數(shù)對比分析的表達(dá)量
03 產(chǎn)品介紹
達(dá)普Galaxy星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng)
1）性能優(yōu)：可一次性完成數(shù)百至數(shù)萬個(gè)細(xì)胞的分離，基因檢測靈敏度高；
2）上樣活：1-4 通道，可靈活選擇樣本數(shù)及細(xì)胞數(shù)量，方便快捷；
3）兼容好：文庫兼容 GenoLab M 和 NovaSeq 6000?等測序平臺(tái)；
4）分析全：自主開發(fā)的StarScope 生信分析軟件可完成分析報(bào)告的輸出；
5）流程活：可接駁下游流程?，如單液滴分選。
04 總結(jié)
基于達(dá)普Galaxy星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng)構(gòu)建兩類腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫在GenoLab M進(jìn)行測序，數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明細(xì)胞UMI水平、細(xì)胞聚類、同基因的表達(dá)量與對比平臺(tái)一致性高，能夠極佳地滿足科研以及臨床對于單細(xì)胞測序需求。
GenoLab M基因測序平臺(tái)與達(dá)普Galaxy星海單細(xì)胞建庫系統(tǒng)均為全流程自主研發(fā)的國產(chǎn)化平臺(tái)，利用雙方平臺(tái)靈活上樣、高性價(jià)比等優(yōu)勢，能大大縮短單細(xì)胞測序周期，全面提高效率并降低測序成本，為臨床應(yīng)用提供從單細(xì)胞到數(shù)據(jù)結(jié)果的全流程解決方案。同時(shí)助力單細(xì)胞多組學(xué)科研普及化和轉(zhuǎn)化單細(xì)胞多組學(xué)研究在臨床中的應(yīng)用。在未來，雙方將進(jìn)一步深化合作，解決單細(xì)胞測序在臨床與醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化中的“卡脖子”技術(shù)，為科研用戶及臨床工作者提供高質(zhì)量、高性價(jià)比的單細(xì)胞測序全流程解決方案。