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9小時(shí)!真邁生物攜手諾唯贊實(shí)現(xiàn)FASTASeq 300平臺(tái)RNA病原極速檢測(cè)
時(shí)間:
2022-12-15
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9小時(shí)!真邁生物攜手諾唯贊實(shí)現(xiàn)FASTASeq 300平臺(tái)RNA病原極速檢測(cè)


? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ◆?快:9小時(shí)即可完成核酸樣本的建庫及SE75 Dual Index測(cè)序

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?準(zhǔn):在超高人源核酸背景下,含量低至0.01%的細(xì)菌與病毒均可準(zhǔn)確檢出

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?穩(wěn):10 ng~1000 ng的核酸均可實(shí)現(xiàn)成功建庫、穩(wěn)定測(cè)序


【?測(cè)試方案?】

樣本組成:為更好地模擬感染樣本真實(shí)組成,使用293細(xì)胞 Total RNA 模擬人源核酸背景,按0.1%和0.01%的比例摻入等量細(xì)菌(Sau1)和病毒(PEDV2、PRRSV3)的RNA。

表1. 樣本組成

9小時(shí)!真邁生物攜手諾唯贊實(shí)現(xiàn)FASTASeq 300平臺(tái)RNA病原極速檢測(cè)

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? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??建庫試劑盒:TruePrep??RNA Library Prep Kit(TR501-503)

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??測(cè)試平臺(tái):FASTASeq 300、NovaSeq 6000

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??分析策略:每個(gè)樣本抽取SE75 20M reads用于后續(xù)分析


【?測(cè)試結(jié)果?】

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??FASTASeq 300測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量表現(xiàn)優(yōu)異,平均Q30>93%。

9小時(shí)!真邁生物攜手諾唯贊實(shí)現(xiàn)FASTASeq 300平臺(tái)RNA病原極速檢測(cè)

圖1. 不同樣本在FASTASeq 300和NovaSeq 6000平臺(tái)測(cè)序質(zhì)量表現(xiàn)


? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?■?FASTASeq 300病原微生物檢出性能優(yōu)異,與NovaSeq 6000檢出水平相當(dāng)。

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圖2. 0.1%~0.01%細(xì)菌(Sau)檢出水平


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圖3. 0.1%~0.01%病毒(PEDV和PRRSV)檢出水平


【?產(chǎn)品介紹 】

建庫試劑盒:諾唯贊重磅推出轉(zhuǎn)座酶RNA建庫試劑盒——TruePrep RNA Library Prep Kit(Vazyme #TR501-TR503),可快速高效建庫,為mNGS的快速檢測(cè)提供新方案。該產(chǎn)品采用新型的轉(zhuǎn)座酶法對(duì)RNA/cDNA雜合鏈片段化,將繁瑣的RNA片段化、二鏈合成、末端修復(fù)、dA-Tailing和接頭連接等步驟轉(zhuǎn)變?yōu)橐徊胶?jiǎn)單的酶促反應(yīng)。

9小時(shí)!真邁生物攜手諾唯贊實(shí)現(xiàn)FASTASeq 300平臺(tái)RNA病原極速檢測(cè)

圖4. TruePrep RNA Library Prep Kit建庫流程與常規(guī)試劑盒流程對(duì)比


? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??建庫耗時(shí)短:超快速的RNA建庫流程,建庫時(shí)長(zhǎng)縮短至2h

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??微生物檢出靈敏度高:可檢出低至0.01%占比的微生物

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ???嚴(yán)格的背景菌質(zhì)控:低背景菌殘留


【?訂購信息 】


9小時(shí)!真邁生物攜手諾唯贊實(shí)現(xiàn)FASTASeq 300平臺(tái)RNA病原極速檢測(cè)


Sau1:Staphyloccocus Aureus,金黃色葡萄球菌;

PEDV2:Porcine epidemic diarrhea virus,豬流行性腹瀉病毒;

PRRSV3:Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,豬繁殖與呼吸綜合征病毒。


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