全基因組甲基化測(cè)序文庫(kù)（WGBS）的堿基比例嚴(yán)重失衡（GC%～20%），這給高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)交付帶來(lái)了極大的挑戰(zhàn)。通常，我們采用摻入高比例的專(zhuān)用平衡文庫(kù)（例如PhiX文庫(kù)、E.coli文庫(kù)）或與GC含量40%～50%的其他應(yīng)用樣本Pooling測(cè)序的方法來(lái)緩解失衡，提高測(cè)序質(zhì)量。然而，這種方法不僅降低了生產(chǎn)效率，還增加了測(cè)序的成本和操作的復(fù)雜性。
真邁生物高通量基因測(cè)序儀全系產(chǎn)品已實(shí)現(xiàn)“甲基化0%平衡文庫(kù)摻入”高質(zhì)量測(cè)序。本次測(cè)試中，在0% PhiX平衡文庫(kù)摻入的條件下，Q30均值≥92%、單index測(cè)序數(shù)據(jù)拆分率均值≥98%，與跟堿基平衡文庫(kù)混合測(cè)序的NovaSeq 6000平臺(tái)數(shù)據(jù)表現(xiàn)相當(dāng)。
【測(cè)試方案】
【測(cè)試結(jié)果】
（1）Q30均值達(dá)92%以上、單index 測(cè)序數(shù)據(jù)拆分率均值達(dá)98%以上
圖1A. FASTASeq 300_0% PhiX重復(fù)測(cè)序表現(xiàn)
圖1B. GenoLab M_0% PhiX重復(fù)測(cè)序表現(xiàn)
圖1C. SURFSeq 5000_0% PhiX重復(fù)測(cè)序表現(xiàn)
（2）數(shù)據(jù)比對(duì)表現(xiàn)優(yōu)異，達(dá)80%以上
圖2A. FASTASeq 300和GenoLab M平臺(tái)重復(fù)測(cè)序的Mapping Rate
圖2B. SURFSeq 5000重復(fù)測(cè)序的Mapping Rate
（3）甲基化類(lèi)型和分布水平表現(xiàn)均高度一致
圖3A. 不同甲基化類(lèi)型的比例
圖3B. 全基因組CG位點(diǎn)甲基化水平分布
真邁生物通過(guò)技術(shù)優(yōu)化升級(jí)，全系產(chǎn)品實(shí)現(xiàn)了“甲基化0%平衡文庫(kù)摻入”高質(zhì)量測(cè)序。這一技術(shù)突破，進(jìn)一步增強(qiáng)了真邁生物測(cè)序儀的產(chǎn)品力，為廣大用戶(hù)提供更為高效、經(jīng)濟(jì)的測(cè)序平臺(tái)工具。
【真邁生物高通量測(cè)序儀產(chǎn)品介紹】
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撰稿：崔青美
編輯：市場(chǎng)部