SURFSeq 5000為用戶提供Balanced Mode(BM,均衡模式)和Enhanced Mode(EM,增強(qiáng)模式)兩大Q40測(cè)序模式。
??在Balanced Mode下，SURFSeq 5000可實(shí)現(xiàn)≥90% bases≥Q30，≥85% bases≥Q40。
??在Enhanced Mode下，SURFSeq 5000可實(shí)現(xiàn)≥95% bases≥Q30，≥90% bases≥Q40。
*Q30/Q40%基于真邁?物企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)品文庫(kù)多輪測(cè)試結(jié)果的中位數(shù)值設(shè)定，該數(shù)值受到樣本狀態(tài)、?庫(kù)質(zhì)量和定量準(zhǔn)確性等因素的影響而發(fā)生變化。
??Balanced Mode是平衡數(shù)據(jù)質(zhì)量和芯片利用率的最優(yōu)解。在該模式下，我們統(tǒng)計(jì)了近3個(gè)?，SURFSeq 5000FCH芯片7大類應(yīng)用方向共116輪的測(cè)試數(shù)據(jù)。其中100輪Balanced Mode PE150測(cè)序數(shù)據(jù)的Q30、Q40均值達(dá)分別達(dá)到了95.1%和91.3%，Output reads均值達(dá)到了2500M reads(官標(biāo)2000M reads)。
??全新的Enhanced Mode在Balanced Mode的基礎(chǔ)上，加入了基于機(jī)器學(xué)習(xí)構(gòu)建的序列特征模型等多維信息，全新的“3D Basecall”可更全面的識(shí)別測(cè)序過程中的“問題序列區(qū)域”，并更準(zhǔn)確地進(jìn)行堿基識(shí)別和Q值打分。統(tǒng)計(jì)16輪Enhanced Mode下WGS PE150測(cè)序數(shù)據(jù)，Q30、Q40均值達(dá)分別達(dá)到了97.1%和95.2%，Output reads均值達(dá)到了2350M reads。
*在數(shù)據(jù)產(chǎn)量Output reads方面，Enhanced Mode相比Balanced Mode會(huì)有5%±2%水平的降低(該差異水平依據(jù)為“對(duì)相同原始圖像分別使用兩種模式下basecall算法獲得的數(shù)據(jù)差值”)，降低比例受到樣本狀態(tài)、文庫(kù)構(gòu)建方式及質(zhì)量和文庫(kù)定量精準(zhǔn)度等因素影響。