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Nano Today (IF17.4)丨GenoLab M單細胞轉(zhuǎn)錄組測序解析納米顆粒與腫瘤細胞的互作關(guān)系
時間:
2024-05-29
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文章梗概


近日,真邁生物用戶羅斯西伯利亞國立醫(yī)科大學生物科學與生物工程中心、托木斯克理工大學化學與生物醫(yī)學工程研究院的研究團隊在Nano TodayIF17.4, JCR Q1)上發(fā)表了題為Nano-bio interaction of magnetic nanoparticles with cells in a tumor at the single-cell level的研究成果。通過研究未修飾的聚乙二醇化氧化鐵磁性納米顆粒(MNPs)或經(jīng)pH低插入肽修飾(pHLIP)的聚乙二醇化氧化鐵MNPs(用于腫瘤酸性微環(huán)境智能靶向的配體)在乳腺癌小鼠模型中的滲透和分布,作者發(fā)現(xiàn)MNPs通過血管破裂和內(nèi)皮細胞胞吞轉(zhuǎn)運作用進入腫瘤組織。隨后,基于GenoLab M單細胞RNA測序,確定了在腫瘤組織中吸收MNPs的細胞群,并揭示了MNPs在調(diào)節(jié)性Trem2+腫瘤相關(guān)巨噬細胞中的累積偏好性


背景介紹

磁性納米顆粒(MNPs)由于其磁特性可以通過交變磁場加熱或非加熱低頻磁場激活,從而發(fā)揮內(nèi)在治療效果或促進藥物釋放,而MNPs在特定部位的累積可通過磁共振成像或磁粒子成像進行監(jiān)測。MNPs對外部磁場的響應能力也為遠程控制提供了條件,從而推動開發(fā)智能納米系統(tǒng)成為可能。然而,開發(fā)一種用于精準治療的納米系統(tǒng),需要深入了解納米系統(tǒng)在體內(nèi)的表現(xiàn)。


研究者之前通過pH低插入肽(pHLIP)對MNPs進行了修飾,創(chuàng)建了一個智能的pH響應的腫瘤傳遞系統(tǒng)。在酸性(低pH)腫瘤微環(huán)境中,pHLIP可以形成α螺旋結(jié)構(gòu),插入并穿過腫瘤細胞膜,因此可作為一種智能的腫瘤靶向配體。將單細胞RNA測序、流式細胞術(shù)、活體顯微鏡,以及透射電子顯微鏡結(jié)合起來,可以描述出MNPs進入腫瘤的路線,揭示腫瘤細胞亞群吞噬MNPs的過程,為設(shè)計更高效的藥物遞送系統(tǒng),開發(fā)有效的腫瘤治療藥物提供新的策略和方法。


*以下為該研究成果解讀

結(jié)果概要

01?MNPs干擾腫瘤組織中不同細胞亞群的表達譜

2個處理組(MNP-PEG:未修飾的聚乙二醇化氧化鐵磁性納米顆粒;MNP-pHLIP:pH低插入肽修飾的聚乙二醇化氧化鐵磁性納米顆粒)和1個對照組(PBS磷酸鹽緩沖液)處理的腫瘤組織進行單細胞RNA測序,一共聚類成10個cluster。其中9個可以被gene marker劃分為具體的細胞亞群(圖1A):4個大的細胞亞群包括兩類巨噬細胞、上皮細胞和成纖維細胞;5個小的細胞亞群分別是中性粒細胞、樹突細胞、內(nèi)皮細胞和B細胞及T細胞。這9類細胞亞群的相對豐度如圖1B所示,兩類巨噬細胞在2個處理組中的占比都比較高,說明了MNPs在巨噬細胞中累積的偏好性。差異基因表達分析發(fā)現(xiàn):兩種MNPs都會被Trem2+巨噬細胞(一類腫瘤特異免疫抑制的巨噬細胞)內(nèi)吞,研究者通過免疫熒光分離MNP(Cy5)+F4/80+Trem2+細胞(圖1C)進行了進一步驗證。共定位分析表明,MNP-PEG處理的36±9%和MNP-pHLIP處理的36±3%的MNP(Cy5)+F4/80+巨噬細胞都是Trem2+類型。隨后,提取兩類占比較多的巨噬細胞的亞群,再次進行降維和聚類分析。發(fā)現(xiàn)這些細胞亞群可被進一步分類為幾個不同類別:M1-like TAM(腫瘤相關(guān)巨噬細胞),M2-like TAM,免疫調(diào)控和促血管因子及增殖的TAM(圖1D),Cluster 4 m被鑒定為CD14+腫瘤浸潤單核細胞,Cluster 6 m幾乎只出現(xiàn)在MNP-pHLIP處理的樣本中,被劃分為S100a8/9+細胞。含有MNPs的所有巨噬細胞亞群中,都能檢測到Creg1+,?Ctsd+,?Cyba+,研究者推測MNPs可能激活了TAM細胞的Nrf2途徑,從而調(diào)節(jié)巨噬細胞對MNPs的反應以及腫瘤微環(huán)境。

Nano Today (IF17.4)丨GenoLab M單細胞轉(zhuǎn)錄組測序解析納米顆粒與腫瘤細胞的互作關(guān)系


圖1 4T1乳腺癌模型小鼠的細胞亞群全景。(A)12,892個細胞通過UMAP聚類成10個亞群;(B)4T1乳腺癌腫瘤組織三個組別細胞亞群的相對豐度,PBS處理組作為對照,處理組是未修飾的聚乙二醇化氧化鐵磁性納米顆粒(MNP-PEG)或經(jīng)pH低插入肽修飾的聚乙二醇化氧化鐵(MNP-pHLIP)處理24h后的樣本,每組2例,*代表FDR<0.05;(C)三個處理的小鼠獲取代表性腫瘤組織切片,抗F4/80(綠色)和抗Trem2(紅色)抗體染色;MNPs為洋紅色。比例尺:100 μm;(D)4T1乳腺癌腫瘤組織的巨噬細胞亞群聚類結(jié)果;(E)巨噬細胞亞群的相對豐度柱狀圖。


結(jié)論

1.?基于單細胞轉(zhuǎn)錄組測序可以獲得MNPs在腫瘤細胞群中無偏分布數(shù)據(jù);

2.?血管破裂和內(nèi)皮細胞吞噬可以解釋MNPs在腫瘤組織中的外滲現(xiàn)象;

3.?MNPs在腫瘤組織中優(yōu)先與Trem2+巨噬細胞相互作用,有望應用于細胞重編程;

4.?單核細胞可以將MNPs傳遞給上皮癌細胞;

5.?與pH低插入肽修飾的結(jié)合會影響MNP在生物體內(nèi)的分布。


參考文獻

Pershina A G, Efimova L V, Brikunova O Y, et al. Nano-bio interaction of magnetic nanoparticles with cells in a tumor at the single-cell level[J]. Nano Today, 2024, 56: 102300.

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