QIAGEN選用QIAseq Targeted DNA Panel基于真邁生物測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)試，測(cè)試結(jié)果顯示On target rate 90%，均一性表現(xiàn)佳，突變位點(diǎn)均可檢出，真邁生物兩個(gè)測(cè)序平臺(tái)VAF(%)?突變的檢出結(jié)果也具有很高的一致性。擴(kuò)增子文庫(kù)中的common sequence區(qū)域測(cè)序質(zhì)量符合預(yù)期。
SURFSeq 5000與GenoLab M VAF(%) 相關(guān)性比較
真邁生物SURFSeq 5000測(cè)試質(zhì)量Q40數(shù)據(jù)已達(dá)到90%，錯(cuò)誤率低至萬分之五（0.05%），數(shù)據(jù)質(zhì)量業(yè)界領(lǐng)先，且測(cè)序成本更低，和行業(yè)同級(jí)別測(cè)序儀相比具有顯著優(yōu)勢(shì)；GenoLab M數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)異，通量靈活（18Gb-300Gb），用戶可根據(jù)相關(guān)應(yīng)用場(chǎng)景自由選擇合適通量。
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QIAGEN SPE（基于單端特異性引物延伸技術(shù)）靶向測(cè)序方案技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)在一個(gè)反應(yīng)管中最多兼容2萬條特異性引物的PCR反應(yīng)，而特異性依舊可高達(dá)90%以上。僅需一條引物結(jié)合到靶向區(qū)域即可擴(kuò)增，整體擴(kuò)增均一性指標(biāo) (Uniformity)?超過97%。
QIAseq FX DNA Library Kit制備的WGS文庫(kù)基于真邁生物測(cè)序平臺(tái)測(cè)序的覆蓋度、均一度等指標(biāo)與其他主流平臺(tái)相當(dāng)。QIAseq FX支持20 pg-1 μg的廣泛樣本起始量，無需片段化和接頭連接反應(yīng)之間進(jìn)行純化，能夠不受基因序列影響，制備出具有最低G/C偏好性的基因文庫(kù)，特別適用于具有高度復(fù)雜性的各種基因組。
真邁測(cè)序平臺(tái)檢測(cè)Small RNA的性能表現(xiàn)一致
Small RNA文庫(kù)僅需SE75即可完成測(cè)序，但是考慮測(cè)序成本和便利性，一般選用PE150上機(jī)。本次測(cè)試選擇了PE150的測(cè)序方案，數(shù)據(jù)則截取R1 75bp進(jìn)行分析，測(cè)試結(jié)果顯示真邁生物測(cè)序平臺(tái)miRNA檢出比例與其他主流平臺(tái)高度一致，在真邁生物不同測(cè)序平臺(tái)間，miRNA檢出比例與表達(dá)量仍具有較高的一致性。
SURFSeq 5000與GenoLab M 檢測(cè)miRNA的一致性比較
QIAseq miRNA Library Kit 是一款專為miRNA等小RNA測(cè)序分析設(shè)計(jì)的NGS解決方案，獨(dú)特的寡核苷酸處理技術(shù)極大程度降低了文庫(kù)構(gòu)建過程中接頭二聚體及其他“污染性”RNA（如hY4 RNA）的存在，無需凝膠電泳、割膠以及回收等一系列繁瑣步驟，最低起始量?jī)H需1ng總RNA。
基于QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium的LightSpeed模塊，可助力真邁生物相關(guān)用戶以更短的運(yùn)行時(shí)間進(jìn)行高性價(jià)比的全基因組測(cè)序（WGS）二級(jí)分析。QCI Interpret是一個(gè)完全可定制的變異解讀方案，為腫瘤和遺傳病應(yīng)用NGS檢測(cè)的變異進(jìn)行注釋和評(píng)級(jí)，目前已解讀超過300萬份報(bào)告。
QIAGEN生物信息解讀完整方案
此次合作測(cè)試，真邁生物測(cè)序平臺(tái)與QIAGEN試劑盒表現(xiàn)出高度的適配性。未來，真邁生物與QIAGEN將深化合作，發(fā)揮雙方在高通量基因測(cè)序領(lǐng)域的優(yōu)勢(shì)，為全球臨床及科研用戶提供精準(zhǔn)高效的測(cè)序平臺(tái)、生物試劑，以及強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析與解讀系統(tǒng)，持續(xù)拓寬測(cè)序應(yīng)用場(chǎng)景，為前沿科研探索和精準(zhǔn)醫(yī)療提供強(qiáng)大支持，共同促進(jìn)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展。
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