您當前位置:首頁資訊公司新聞
真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案
時間:
2024-07-11
瀏覽次數:

真邁生物與專注于單細胞技術服務的尋因生物開展深度合作,雙方整合技術資源優(yōu)勢,共同打造了高質量的國產單細胞組學整體解決方案,該方案將為推動單細胞技術應用和發(fā)展提供強有力的支持。


雙方合作開展了單細胞整體解決方案的性能評價工作,評價采用了尋因生物單細胞免疫組試劑盒構建了多物種多組織樣本單細胞文庫,文庫樣本同時在SURFSeq 5000和NovaSeq 6000測序平臺進行測試分析。


結果顯示,SURFSeq 5000在Clean bases ratio以及單細胞文庫質控中的多項指標均表現(xiàn)出色,其各樣本獲得read數、識別細胞數以及細胞中位基因數等指標均優(yōu)于NovaSeq 6000。



測試方案



表1 測試方案

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案



測試結果



?下機數據質量高,Clean bases ratio表現(xiàn)更優(yōu)

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖1 下機數據對比


?單細胞轉錄組文庫質控結果優(yōu)異,且各樣本獲得read數、識別細胞數、每個細胞中位基因數等方面表現(xiàn)更優(yōu)

表2?單細胞轉錄組文庫質控對比結果

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案


?共享cell barcode高達97%

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖2 共享cell barcode對比結果


?高變基因相關性高達99%

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖3 高變基因相關性對比結果

注:每個點表示一個細胞表達基因分別在SURFSeq 5000 和 NovaSeq 6000平臺中的 UMI counts 分布。


?所有基因表達量相關性達90%以上

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖4 所有基因表達量相關性對比結果


?平臺間一致性高

真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖5 細胞注釋一致性對比結果



真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案
真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案
真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案
真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案
真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖6 細胞聚類對比結果


真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

圖7 各cluster中細胞比例結果


真邁生物與尋因生物聯(lián)手打造的國產單細胞組學整體解決方案展現(xiàn)出了優(yōu)異的性能與可靠性,該方案可為科研人員提供高質量的單細胞組學數據,成為推動大規(guī)模單細胞測序深入研究的重要工具。



產品介紹



尋因單細胞免疫組產品



尋因單細胞免疫組庫產品,立足尋因生物卓越的研發(fā)創(chuàng)新能力和品控工藝水平,致力于提供行業(yè)精準數據產出和全流程技術服務,助力免疫細胞的分化、發(fā)育和免疫識別等功能研究,在腫瘤免疫治療、感染性疾病、自身免疫疾病和疫苗/抗體研究等領域具有廣泛的應用前景。以我所專,助您所研。


真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案

*尋因單細胞免疫組庫產品詳情敬請關注尋因生物官網https://www.seekgene.com/


真邁生物SURFSeq 5000



SURFSeq 5000應用廣泛,速度快,質量優(yōu),成本省。它以桌面儀器成本、小樣本數量開機成本實現(xiàn)了與大型機器相媲美的高通量測序價格。真邁生物致力于持續(xù)滿足行業(yè)對測序優(yōu)化的需求,與合作伙伴深度合作,為前沿科研探索和精準醫(yī)療提供強有力的支持。


真邁生物+尋因生物:打造高質量國產單細胞組學整體解決方案





更多關于單細胞文庫質控參數意義解讀可通過以下連接了解:

https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzU2Nzg3MzYyOA==&action=getalbum&album_id=3074897199014150144#wechat_redirect


相關推薦
暫無數據