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真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案
時間：
2025-04-23
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測序數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異，關鍵指標表現(xiàn)突出：

基礎數(shù)據(jù)優(yōu)秀：Raw Q30＞91%、Mapped rate＞99.4%、Adapter-Adapter＜0.003%

核心指標穩(wěn)定：臺間Peak count 和 FRiP 均表現(xiàn)出良好的穩(wěn)定性和一致性


ATAC-seq和CUT&Tag作為研究染色質(zhì)結構的前沿技術，可精準解析染色質(zhì)可及性和蛋白-DNA互作。針對這兩類文庫常見多峰干擾的測序問題，真邁生物聯(lián)合翌圣生物推出國產(chǎn)解決方案，采用高性能建庫試劑和SURFSeq 5000測序平臺，在保證數(shù)據(jù)質(zhì)量的同時顯著降低成本，為非標準文庫測序提供了可靠選擇。


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案

圖1. 標準文庫-WGS（上圖）和非標準文庫-ATAC-seq（下左圖）/CUT&Tag（下右圖）峰圖表現(xiàn)



01 測試


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案


1、數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異

  • Raw Q30均值達91%以上，且臺間重復穩(wěn)定

  • Adapter-Adapter rate低至0.003%，有效數(shù)據(jù)利用率極高

真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案

圖2.下機數(shù)據(jù)表現(xiàn)


2、Mapping 統(tǒng)計

  • Mapped rate均值達99.4%，其中ATAC-seq的mapped rate 遠高于ENCODE數(shù)據(jù)庫標準的95%

  • 臺間Peak count、FRip 表現(xiàn)穩(wěn)定且一致

真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案

圖3.Mapping 比對分析



3、Peak 一致性分析

  • 信噪比高，且臺間Peak 一致性高

真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案

圖4.臺間Peak 一致性分析

ATAC-seq核心指標包括測序深度、TSS富集分數(shù)、FRiP、IDR、比對率、Peak count、Duplicate Rate和文庫復雜度，核心指標參數(shù)可參考ENCODE數(shù)據(jù)庫：https://www.encodeproject.org


02 產(chǎn)品訂購


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標準文庫國產(chǎn)化解決方案


真邁生物與翌圣生物強強聯(lián)合，充分發(fā)揮雙方在酶制劑研發(fā)和測序平臺構建領域的技術優(yōu)勢，共同打造覆蓋“原料-設備-應用”全產(chǎn)業(yè)鏈的創(chuàng)新解決方案。通過構建開放共享的行業(yè)生態(tài)系統(tǒng)，持續(xù)為全球科研和醫(yī)療機構提供更精準、更高效的測序整體解決方案。

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